จากการที่ฝนตกหนักทำให้เกิดน้ำท่วมทั่วประเทศ นอกจากนี้ทาง กทม. ยังจำเป็นต้องปรับปรุงระบบระบายน้ำ การที่ขยะไปอุดตันทำให้น้ำมีการระบายได้ไม่ดีเช่นเดียวกัน จากการสำรวจพบที่นอนและเฟอร์นิเจอร์เก่าและของใช้ในบ้านทั่วไปอื่น ๆ ที่ประชาชนไม่ต้องการแล้ว ได้ถูกทิ้งลงในคลองกรุงเทพฯ ขยะชิ้นใหญ่ขนาดนี้ได้ปิดกั้นการไหลของน้ำในการไหลเข้าสู่แม่น้ำเจ้าพระยา
ทุกวันทาง กทม. จะมีการดึงขยะประมาณ 5-10 ตันออกจากคลองและแม่น้ำในกรุงเทพฯ แต่ก็เจอขยะจำนวนมากในทุก ๆ วันกรมระบายน้ำและระบายน้ำทิ้ง กทม. ออกมาเปิดเผยว่า สถานีสูบน้ำหลักบริเวณพระโขนงและอุโมงค์น้ำ ร.9 จุดเชื่อมต่อทั้ง 2 นี้เป็นโอกาสสุดท้ายที่จะดักจับขยะจากน่านน้ำก่อนที่จะไหลลงสู่แม่น้ำต่อไป
ปริมาณน้ำที่ไหลลงคลองจะถูกควบคุมโดยสถานีสูบน้ำหลัก 4 แห่งและประตูสถานีเหล่านี้จะทำหน้าที่เป็นยามเฝ้าประตูเพื่อกรองขยะที่ไหลลงสู่แม่น้ำสายหลักในกรุงเทพฯ ป้องกันทำให้แม่น้ำไม่สกปรก