รัฐบาลอินโดนีเซียกำลังเผชิญหน้ากับการวิพากษ์วิจารณ์จากนักวิทยาศาสตร์ชั้นนำ และผู้ร่างกฎหมายบางคนว่า การปรับโครงสร้างครั้งใหญ่ ที่นำสถาบันวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีชั้นนำของประเทศมารวมกัน อาจเป็นตัวบ่อนทำลายความพยายามในการวิจัย นโยบายดังกล่าวจะทำให้สถาบันวิทยาศาสตร์ เทคโนโลยี และการวิจัยกว่าครึ่งโหลรวมเข้ากับสำนักงานวิจัยและนวัตกรรมแห่งชาติ (BRIN) ซึ่งรัฐบาลหวังว่าจะปรับปรุงการเข้าถึงทรัพยากรและเงินทุน และเพิ่มความสามารถในการแข่งขัน “เป็นที่ชัดเจนว่า การวิจัยของชาวอินโดนีเซียนั้น ยังห่างไกลจากระดับประเทศเพื่อนบ้านของเรา” ลัคสนา ตรี ฮันโดโก หัวหน้า BRIN กล่าว “ดังนั้น ตอนนี้จึงเป็นเวลาที่เหมาะสมมากที่จะดำเนินการจริง และเปลี่ยนสถานการณ์” แต่นักวิทยาศาสตร์และสมาชิกรัฐสภาบางคนเตือนว่า การสั่นคลอนอาจเพิ่มเทปสีแดง เห็นนักวิทยาศาสตร์รุ่นเยาว์หลายสิบคนถูกเลิกจ้าง และอยู่ในมือของนักการเมือง
ศาสตราจารย์อามิน โซบันดริโอ หัวหน้าสถาบันจนถึงปีที่แล้ว กล่าวว่า ท่ามกลางความกังวลอื่น ๆ เกี่ยวกับการปรับโครงสร้างใหม่ ความเสี่ยงของความล่าช้าในการพัฒนาวัคซีนและการจัดลำดับจีโนม และอนาคตของความเป็นอิสระทางวิทยาศาสตร์
