มาเลเซียแสดงความกังวลเรื่อง การเป็นหุ้นส่วนด้านความมั่นคงที่เกี่ยวข้องกับออสเตรเลีย, สหราชอาณาจักร และสหรัฐอเมริกา หรือที่เรียกว่า AUKUS อาจจุดชนวนทำให้เกิดการแข่งขันอาวุธนิวเคลียร์ในภูมิภาคอินโด-แปซิฟิก มีข้อมูลเล็ดลอดออกมาว่าออสเตรเลียจะสร้างเรือดำน้ำพลังงานนิวเคลียร์จำนวน 8 ลำภายใต้ความร่วมมือดังกล่าว ซึ่งมุ่งหวังทำลายล้างจีน
จากข้อตกลงในครั้งนี้มาเลเซียมีความกังวลว่าจะเป็นการกระตุ้นให้มหาอำนาจประเทศอื่น ๆ มีความก้าวร้าวมากขึ้น อยากลุยอยากปะทะ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในทะเลจีนใต้ สำนักนายกรัฐมนตรีของมาเลเซีย (PMO) กล่าวในแถลงการณ์ ดังนั้นจึงเรียกร้องให้ทุกฝ่ายหลีกเลี่ยงการยั่วยุ และการแข่งขันด้านอาวุธในภูมิภาค ในฐานะประเทศในอาเซียน มาเลเซียถือหลักการ, เสรีภาพ และความเป็นกลาง (ZOFPAN)
นายกรัฐมนตรีอิสมาอิล ซาบรี ยาคอบ ของมาเลเซียได้รับโทรศัพท์จากนายสก็อต มอร์ริสัน รัฐมนตรีช่วยว่าการชาวออสเตรเลียเมื่อวันศุกร์ โดยมีการแจ้งข้อตกลงของ AUKUS และอธิบายรายละเอียดเกี่ยวกับข้อตกลงดังกล่าว ในระหว่างการพูดคุย Ismail Sabri เน้นย้ำถึงความสำคัญของการเคารพจุดยืนของมาเลเซีย เกี่ยวกับเรื่องเรือดำน้ำพลังงาน นิวเคลียร์ที่ปฏิบัติการในน่านน้ำ
